Diarrea en la semana de descanso

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Hola, tengo una duda, yo vengo tomando las pastillas anticonceptivas todos los dias y a la misma hora, pero queria saber que pasa al tener diarrea dos horas despues de haberla tomado pero en la cuarta semana(ya la 5ta pastilla de descanso), que pasa con la menstruacion? Afecta en algo al organismo? Como se siguen tomando?