El dolor del pene no es muy frecuente ya que habitualmente las patologías genitales del hombre afectan con mas frecuencia al escroto. Sin embargo, algunos trastornos que afectan al pene son dolorosos: el caso de parafimosis que es una constricción del glande por el prepucio y en estos casos el pene no puede ser descubierto completamente. La enfermedad de Peyronie, que se caracteriza por dolores y una desviación del pene erecto, así como la gangrena de Fournier son enfermedades raras. Más frecuente y muy doloroso es el traumatismo del pene erecto durante el coito o incluso el priapismo (es una erección persistente por ausencia de evacuación de la sangre en los vasos sanguíneos del pene). En algunas infecciones también pueden aparecer dolores del pene.