La exotoxina es una toxina (sustancia tóxica) sintetizada y liberada en el organismo huésped por bacterias todavía vivas. Esto lo diferencia de la endotoxina, liberadas sólo cuando la bacteria se destruye. Las exotoxinas las producen, principalmente, las bacterias Gram positivas entre las que destacan diferentes bacilos patógenos como la difteria y el tétanos. Las exotoxinas son generalmente más virulentas que las endotoxinas. También tienen un poder inmunógeno más fuerte y de ahí deriva su utilización para crear diversas vacunas. Las exotoxinas están presentes en las vacunas en su forma no tóxica, después de un tratamiento con formol y calor: hablamos, entonces, de anatoxinas.