El esfínter anal define un músculo situado en la parte terminal del tubo digestivo. Permite la defecación. A este nivel exsiten dos esfínteres: un esfínter interno, cuyo funcionamiento es automático y está formado por fibras musculares lisas y un esfínter externo, bajo el control de la voluntad. El mecanismo de la defecación es el siguiente: la presencia de heces en la ampolla rectal hacen sentir la sensación de necesidad y se relaja el esfínter anal interno. Inmediatamente después, el esfínter anal externo se contrae por acto reflejo. El paciente puede seguir contrayendo el esfìnter a la espera de poder ir al baño y la defecación se inicia cuando el paciente decide liberarlo. En caso de anomalía en estos esfínteres, estos mecanismos no son posibles y puede ocurrir pérdida involuntaria de las heces: se habla de incontinencia fecal o rectal.