La encefalopatía de Wernike, que no está ligada al área de Wernike dedicada al lenguaje, es una patología neurológica. Sus principales maifestaciones son la imposibilidad de mover los ojos (que presentan movimientos de sacudida llamados nistagmus), una diplopía (visión doble), una pérdida de memoria a corto término y dificultades en la deglución. En un caso sobre 10 encontramos también confusión mental y ataxia (ausencia de coordinación de movimientos y pérdida de equilibrio). Para tratar la encefalopatía de Wernike se intenta restablecer la tasa normal de vitamina B1 inyectándola directamente por vía intramuscular o intravenosa.