Las amígdalas se encuentran en la esfera ORL y son en total cinco pares. Tienen un rol importante en la defensa del organismo frente a agentes externos, como los virus y las bacterias, mediante la producción de anticuerpos para luchar contra la proliferación. Las más conocidas son las amígdalas palatinas, pequeñas masas localizadas en la parte inferior de la garganta y alrededor de la úvula. Las amígdalas alcanzan su tamaño máximo en la pubertad. Cuando están infectadas, sobre todo en caso de anginas, las amígdalas se hinchan y la deglución se hace dolorosa. En caso de infecciones repetidas, las amígdalas se pueden extirpar: es la amigdalectomía.