El Clostridium difficile o C. difficile es una bacteria que puede colonizar el sistema digestivo. Su proliferación provoca generalmente sólo una diarrea. Sin embargo, la situación podría empeorar y degenerar en una colitis pseudomembranosa (diarreas, calambres importantes y fiebre). Más raramente todavía la colitis puede convertirse en un megacolon tóxico, mortal si no se opera rápidamente. El Clostridium difficile ataca sobretodo a las personas cuyo sistema inmunitario está debilitado o después de tomar un tratamiento importante a base de antibióticos. El 5 % de la población es resistente a esta bacteria : esta bacteria puede colonizar su intestino sin causar ningún problema.