Anteriormente conocida como flora intestinal humana, la microbiota intestinal humana reagrupa todos los microorganismos presentes en el aparato digestivo humano, denominado microbioma intestinal. La microbiota intestinal representa la más grande microbiota del cuerpo humano y, como tal, es objeto de numerosos estudios científicos. El hombre y su microbiota intestinal cooperan en armonía. En este caso, hablamos de mutualismo. Las funciones metabólicas de la microbiota intestinal aseguran un papel primordial que influye mucho en la fisiología humana.