Una candidiasis sistémica es una enfermedad grave. Un hongo (principalmente la Cándida albicans) coloniza, por vía endógena o exógena, uno o más órganos internos o incluso el conjunto del organismo. Esto puede ocurrir en el curso de una afección grave que provoque una disminución de la inmunidad (niños prematuros, grandes quemados, pacientes en cuidados intensivos, los pacientes trasplantados o en quimioterapia o en los pacientes con VIH). El riesgo de muerte es alto (por encima del 40%). Un tratamiento antifúngico debe iniciarse inmediatamente.