Hola,
Probablemente no pasará nada pero no tiene sentido...primero deberías hacerte una prueba de embarazo para saber si estás o no embarazada y si es negativa ponerte la inyección (pero teniendo en cuenta que si es la primera vez que te la pones debes esperar a que llegue tu regla). Revisa este enlace
Inyecciones contraceptivas Saludos.